L’école de l’érudition en réseau a été créée en 1999 par les quatres institutions suivantes : l’École nationale des chartes (ENC, Paris), le Centre d’études supérieures de civilisation médiévale (CESCM, CNRS / université de Poitiers), l’École pratique des hautes études (EPHE, section des sciences historiques et philologiques, Paris) et l’Institut de recherche et d’histoire des textes (IRHT, CNRS, Paris-Orléans). En 2004, la section des sciences religieuses de l’EPHE a rejoint l'École de l’érudition.